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新手小吴学习笔记day3

conda安装与使用

可从镜像网站获得地址 然后用wget 链接 下载

运行下方代码进行安装激活

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh 
source ~/.bashrc

添加镜像

conda config --add channels 链接

新建虚拟环境及软件安装

conda info --envs  #查看环境
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
#指定版本python3，安装fastqc trimmomatic
conda activate rna-seq #激活新环境

代码引用自生信星球学习小组教程（豆豆&花花）

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    需要对249本软件著作实现句子级别全文检索，这些著作均为PDF文件，不使用现有的框架如lucene，自己实现的方法如下： 1、从PDF文件中提取文本，这里的重点是如何最大可能地还原文本。提取之后的文本，一个句子一行保存为文本文件。 2、将所有文本文件合并为一个单一的文本文件，这样，每一个句子就有一个唯一行号。 3、对每一行文本进行分词，建立倒排表，倒排表的格式为：词=包含该词的总行数N=行号
按字母分类： ABCDEFGHIJKLMNOPQRSTUVWXYZ其他