Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子

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OVITO 是一款功能强大的分子动力学模拟软件,能够帮助用户轻松进行各种分子动力的模拟,为研究分子之间的运动提供了帮助。软件操作操作简单便捷,非常适合需要研究分子动力学的用户,满足用户的各种分子运动研究需求。

对于体系中有多种原子,如何选择指定的原子?

以 ZnO 为例进行说明操作步骤:

选择 “Select style” 菜单

Figure 1

Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子_第1张图片

选择 “Delected selected” 菜单

Figure 2

Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子_第2张图片

进行原子种类的选择

Figure 3

Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子_第3张图片

√选择一种原子就是删除一种原子

Figure 4

Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子_第4张图片

Figure 5

Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子_第5张图片

Figure 6

Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子_第6张图片

Figure 7

Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子_第7张图片

采用 Density Profile Tool 进行数密度分析:

这个后处理软件可以计算数密度、质量、电荷电子分布等性质。

ZnO 原子数密度分析

Figure 8

Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子_第8张图片

ZnO 原子数密度分析

Figure 9

Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子_第9张图片

Zn 原子数密度分析

Figure 10

Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子_第10张图片

O 原子数密度分析

Figure 11

Ovito 技巧:筛选体系中特定种类的原子_第11张图片

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