小郑的学习笔记
小郑的学习笔记

2018-10-05 如何把vcf 文件合并

最近使用了CLC做分析，发现收费软件的速度真的是很快哇，而且可视化界面设计的很不错。但是我们也不能太依赖这些收费的软件，比如我先在得到了每个样本的vcf文件，我想合并，这个软件就实现不了，这不，还是得学一点其他技术。

我网上查了查，发现可以使用bcftools

分成三步走
1.压缩vcf文件


压缩

  1. 建立索引


    index

  2. 合并


    合并

这个只是我做了个test，因为我的样本比较多，所以我后续还是写个脚本批量完成的

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