如何NCBI上传Genbank数据

作者：llama
审稿：童蒙
编辑：amethyst

01 登录NCBI

与前面是相同的步骤，此处就不再重复了，登录完成后同样点击首页的submit进入即可，进入后往下翻页，看到Genbank提交数据，选择对应的选项即可，根据提交的数据不同，进行选择即可，后续的步骤都是类似的，此处以提交叶绿体基因组为示例。

02 填写信息

提交叶绿体基因组用的BankIt这个工具，其他不同类型的基因组选择不同的选项即可，前面的步骤都是一样的，填写对应的信息，同样需要填写Bioproject号和Biosample号，如果没有，就填写no，网页会自动进行跳转至Bioproject号申请和Biosample号申请的界面，填写对应信息即可。

03 上传数据

叶绿体基因组除了上传基因组的fasta数据之外，还需要上传注释的tbl文件，此文件可以通过多种注释软件获得，或者自己造一个也是可以的，但是必须满足NCBI所要求的五列格式，格式如下：

其中第一列为起始位置；第二列为终止位置，其中<和>表示正反向；第三列为特征名，例如：CDS，mRNA，rRNA，gene或exon；第四列为限定词的类型，例如：product，number，gene或note；第五列为限定词的相关描述。

上传完成后，最后一步同样为再次检查信息，检查完成后，同样会发送邮件给对应的邮箱，如果后续需要修改信息，同样可以发送邮件给NCBI的工作人员。