学习小组Day4笔记--孙大雅

今日开始学习R啦~

1.R和Rstudio

(1)R是什么

  • R是一种编程语言,汇集了许多函数,能够提供统计、绘图等若干功能。
  • R语言软件界面简单,通常使用Rstudio

(2)Rstudio是什么

个人理解为R的可视化(所有数据、结果更加直观)

了解了基本概念,开始进行准备工作~

2.下载R和Rstudio

(1)下载R

第一步:Bing直接搜索R,然后点进去

第二步:点击download R,就会跳转至相应镜像CRAN

第三步:CRAN按照国家排列,找到“China”,选择离自己近的镜像然后点进去

(作为一个北方银~我暗戳戳觉得兰大的镜像蛮快的……)


第四步:按照自己系统下载R就行(默认下载是最新版本,如果想要特定的版本,下面也会有选项)

(2)下载Rstudio

第一步:还是一样的Bing搜索,然后直接找到Download

第二步:免费的版本足够生信小白使用了

(Rstudio我感觉网站不是特别稳定……可以等一等或者再刷新)

第三步:选择自己需要的版本下载即可

3.安装R和Rstudio

(1)电脑英文用户名

就一马平川的安装就好了(引用健明大神的一句话:要是不懂就不要随便更改默认选项)

(2)电脑系统中文用户名

因为我不是中文用户名……所以安利一下大神的教程

来自:生信星球
当Rstudio杠上中文用户名

以上为准备工作~现在开始打开Rstudio

4.认识Rstudio界面

(1)Rstudio界面

如图所示

(2)Rstudio显示设定

若想更改外观设置:Tools--Global Options

然后可以更改字体、字的大小、背景等等

改完了一定要Apply!

5.R语言的基本用法及操作

(1)工作目录及R project

传统的工作目录设定

getwd()             #查看当前工作目录
setwd(dir="…") #注意:1.dir=(可省略);2.引号;3.反斜线 “/”

R只能对应一个工作目录,但如果遇到多个项目,需要对应多个工作目录,R project就很有必要了

R可以同时打开多个Rproj文件,他们处于多个独立的Rstudio界面中,不会相互影响。如果仅仅创建R脚本,不创建Rstudio项目,则不同的R脚本只能处于同一个Rstudio界面中,共享一个工作路径,也共享环境变量,可能相互影响,这时两个R脚本不能同时运行。

引用:https://bookdown.org/xiao/RAnalysisBook/r.html

R project设定

  • 点击脚本区,新建R project


  • R project是绑定文件夹而存在,可以选择新建文件夹或者选择已经存在的(这里我新建一个)


  • 新建文件夹的名字,选好路径


  • 此时打开了一个新的session,不干扰目前正在进行的项目


(2)显示文件列表

代码如下:

dir()

(3)基本运算:

(4)对变量进行赋值

  • 第一种方法:
a<- 3
  • 第二种方法:按Alt键加上减号(真的这是我第一次知道!!!)
  • 那么如何查看变量呢:输入想查看的变量敲回车就可以了
    其实现在在右侧enviroment栏也会看见列出的变量


(5)删除变量:一键清空

  • 清除单一变量
rm(变量名称)
  • 清除多个变量
rm(变量1,变量2)
  • 一键清空批量删除(这是个很棒的技能)
    此刻右侧Enviroment就空了
rm(list = ls())#清空所有变量

(6)列出历史记录

  • 列出所有记录
history()
  • 列出几条历史记录(10条为例)
history(10)

(7)清空控制台(超棒的技能)

  • Ctrl+L键

(8)保存工作空间

save.image  #保存数据和绘图函数

最后的最后:今日思维导图


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