初试扩增子测序数据的meta分析

测序数据越来越多,发表文章大多被要求上传原始数据,这为进行meta分析提供了丰富的可用资源。近年来,越来越多学者开始尝试meta分析回答单一研究小样本无法回答的大问题。颇有‘一切皆可meta’的趋势。但meta分析需要进行严谨科学的假设,规范的数据收集以及严格的数据整合,而非简单的将收集来的数据进行原样分析,然后简单加总。其中奥秘,需深刻把握。

这张图是我的尝试。
对收集的每一个数据集,各自进行拼接,引物识别,质控,去冗余,进行closed_reference聚类以便拥有同一套OTU编号,构建OTU表。待各自完成以上流程后,合并所有OTU表。


meta_workflow.jpg

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