Cell | “单细胞 + 时空组”分析人类肠道发育过程

**文献信息：** 标题：[Spatiotemporal analysis of human intestinal development at single-cell resolution](https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)31686-X) 中文：”单细胞 + 时空组“分析人类肠道发育过程 杂志：Cell 时间：2020.12 单位：英国牛津大学 **摘要：** 人类肠道的发育还没有被很好地理解。在这里，我们将单细胞RNA测序和空间转录组学联系起来，以表征肠道形态发生的时间。我们鉴定了101种细胞状态，包括上皮细胞和间充质祖细胞群和与关键形态发生里程碑相关的程序。我们描述了隐窝-绒毛轴形成的原理;发育中的肠道的神经、血管、间充质形态发生和免疫群体。我们确定了发育中的成纤维细胞和肌成纤维细胞亚型的分化层次，并描述了它们的不同功能，包括作为血管生态位细胞。我们确定了Peyer’s patches和gut-associated lymphoid tissue (GALT)的起源，并描述了位置特异性免疫程序。我们利用我们的资源提出了一个无偏的分析形态梯度，直接连续波的细胞分化和定义细胞和位置联系到罕见的发育性肠道疾病。我们编制了一个公开的在线资源，时空分析资源的胎儿肠道发育(STAR-FINDer)，以促进进一步的工作。  **1 Generation of a spatio-temporal transcriptional atlas of human intestinal development** 人肠道发育过程时空转录组地图产生  **2 Spatio-temporal analysis of intestinal development with ST and scRNA-seq integration** 肠道发育时空和转录组数据分析  **3 Cataloguing in utero epithelial maturation and crypt development** 子宫上皮细胞成熟和隐窝发育的编目  **4 Coordinated development of mesenchymal and endothelial compartment cell** 间充质细胞与内皮细胞的协调发展  **5 Intestinal morphogen gradients in specific cell types and spatial locations** 特定细胞类型和空间位置的肠道形态梯度  **6 Early intestine immune colonization and immune-stromal interactions** 早期肠道免疫定殖和免疫间质相互作用  **7 Application of in utero gene expression profiles to developmental disease** 子宫内基因表达谱在发育性疾病中的应用  **更多：** [Cell | 人类肠道发育进程的时空图谱](https://mp.weixin.qq.com/s/yu6C0O-eDVlGn0DMstNDfg)