模型进阶：基于R语言APSIM模型高级应用及批量模拟

原文：基于R语言APSIM模型高级应用及批量模拟

随着数字农业和智慧农业的发展，基于过程的农业生产系统模型在模拟作物对气候变化的响应与适应、农田管理优化、作物品种和株型筛选、农田固碳和温室气体排放等领域扮演着越来越重要的作用。APSIM (Agricultural Production Systems sIMulator)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。APSIM模型有Classic和Next Generation两个系列模型，能模拟几十种农作物、牧草和树木的土壤-植物-大气过程，被广泛应用于精细农业、水肥管理、气候变化、粮食安全、土壤碳周转、环境影响、农业可持续性、农业生态等诸多与农业生产和科研有关的领域。APSIM模型内核算法是基于Fortran语言开发的，软件界面是基于C#进行开发，组件式驱动，各个模块可以自由组合。了解和熟悉APSIM模型的关键算法和软件的操作是学习APSIM模型的基础。此外，想要成为一名优秀的作物模型使用者与科研团队不可或缺的人才，除了掌握对作物模型相关知识之外，还要掌握模型的快速模拟和高效数据分析能力。R语言是一门应用场景广泛、简单易学的程序语言，APSIM模型开发了许多R语言辅助包，在APSIM模型的气候、土壤、管理措施等数据准备，自动化模拟，参数优化和结果分析上都发挥着重要的作用。因此，为辅助提高作物模型工作者的APSIM模型使用技术，我们举办了作物模型高级应用实战技术培训班，系统学习如何利用R语言来快速使用APSIM模型。本次我们精选大量作物模型应用案例，全程干货，全面熟悉APSIM这一综合型农业生态系统模型，提高学员模型应用能力、数据分析和图表制作技能。如果你是资深模型爱好者，这次可以进一步熟悉各个模块的相关算法；如果你是该模型入门者，这次培训将让你体验一键模拟的乐趣。

专题一、APSIM模型应用与R语言数据清洗

1)作物生长模型的概念

2)作物生长模型的发展现状

3)APSIM模型的开发历程

4)APSIM模型的模块及模拟流程

5)APSIM模型操作

APSIM的安装

APSIM模型操作界面讲解

6)R语言编程与数据清洗

专题二、APSIM气象文件准备与R语言融合应用APSIM自带的气象数据的准备

1）APSIM气象文件.met的介绍

2）日照转辐射算法

3）APSIM气象文件转化

4）APSIM模型陆气交换和能量平衡过程

案例一：使用R语言进行气象文件的生成

案例二：使用R语言将气象共享网数据/NC等数据批量生产APSIM气象文件

专题三、APSIM模型的物候发育和光合生产模块APSIM物候发育和光合生产

1)APSIM模型的生育期尺度

2)APSIM模型的积温计算

3)APSIM模型的生育期算法

4)APSIM模型的生育期影响因子及算法

5)APSIM模型光合生产算法

专题四、APSIM物质分配与产量模拟

1、 APSIM模型的物质分配算法

2、 APSIM模型产量模拟模块

1)APSIM模型的穗粒数模拟

2)APSIM模型的产量模拟

3)APSIM模型的产量相关参数

案例一：作物潜在生物量和潜在产量的模拟

案例二：不同品种参数下作物产量的模拟

专题五、APSIM土壤水平衡模块APSIM模型的土壤水分平衡算法

1)土壤水蒸散和植物蒸腾算法

2)土壤水径流和排水算法

3)土壤水力参数的测试

案例一 APSIM模型输入参数和土壤文件的制备

案例二 APSIM模型土壤参数在数据缺失情况下的近似估算

专题六、APSIM土壤碳、氮平衡模块APSIM模型土壤养分动态过程模拟及温室气体排放的模拟

1)氮素的矿化和固定过程

2)氮素的硝化作用与反硝化作用

3)土壤N2O的模拟

APSIM模型土壤碳库模型及土壤有机碳SOC的模拟

1)土壤碳库模型的发展历程

2)土壤碳的周转模型

3)土壤有机碳的模拟

案例一 APSIM模型N2O排放模拟和土壤有机碳模拟

专题七、APSIM农田管理模块与情景模拟APSIM模型的农田管理措施的准备

1)APSIM模型播期和播种密度设置

2)APSIM模型施肥设置（化肥+有机肥）

3)APSIM模型的灌溉设置

4)APSIM模型秸秆还田设置

5)APSIM模型多年模拟和轮作模拟

案例一：APSIM模型模拟气候变化对作物生长的影响

案例二：APSIM模型模拟多年轮作下土壤有机碳和温室气体排放的影响

案例三：APSIM模拟模拟不同管理情景对作物产量的影响

专题八、APSIM模型参数优化和结果分析与模型评价APSIM模型的参数优化

1)APSIM模型的主要遗传参数

2)APSIM模型的参数优化方法

案例一：使用MCMC等多种方法对APSIM模型的参数进行优化

案例二：使用R语言批量读取模拟结果以及对APSIM模型进行评价

案例三：使用R语言对模拟结果进行可视化（模拟结果的动态图和1：1图等）

专题九、更多案例模拟与疑难解答

实例回顾、训练、巩固