conda环境基本操作

1 查看所有conda环境

conda info -e 
或
conda env list

2 创建和删除环境

# 创建python2.7版本的环境
conda create -n env_python2.7 python=2.7
# 创建python3.6版本的环境
conda create -n env_name python=3.6
# 删除环境
conda remove -n env_python2.7 --all

3 利用yml文件创建带多种依赖的环境

yml文件基本格式（env.yml）：

name: env_name
channels:
- bioconda
- conda-forge
dependencies:
- bwa=0.7.17
- samtools=1.9
- git

创建环境

conda env create -f env.yml

4 激活和关闭环境

# 激活环境
conda activate env_python2.7
# 关闭环境
conda deactivate

5 重命名环境

# 无法直接重命名，实际上是创建一个环境相同的环境，然后删除原环境
conda create -n new_name --clone env_python2.7
conda remove -n env_python2.7 --all